北京大学生命科学学院 教授

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主要研究方向

1、蛋白质组学新技术新方法-蛋白质高可信度鉴定、定量及翻译后修饰位点的质谱鉴定

2、肿瘤细胞表面新生抗原大规模鉴定及其在肿瘤发生、发展与转移中的作用机制

3、基于肿瘤细胞表面新生抗原的特异性抗体、抗体药物偶联物及免疫多肽组的制备与体内作用机制

4、神经系统退行性病变相关蛋白与小胶质细胞激活的调控作用机制

5、外泌体临床检测新方法、个性化治疗关键调控蛋白及MRM 靶向质谱定量的临床多标志物检测新方法

主要研究进展

利用生物质谱大规模鉴定与发现重大疾病发生发展相关蛋白及其动态变化，特别关注蛋白质翻译后修饰（单磷酸化及多磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化、糖基化、组蛋白组合修饰等）对其生物学功能的影响。针对神经系统退行性病变中小胶质细胞激活、Aβ清除与降解、神经元死亡、肿瘤细胞表面新生抗原、免疫细胞和肿瘤微环境相关巨噬细胞表面等发现并鉴定关键蛋白及其修饰变化，发现新的关键靶标和标志物；结合细胞与动物模型和临床人类标本分析，对肿瘤细胞表面特异蛋白和基因融合蛋白进行体内外功能研究，同时制备特异性抗体、多肽和抗体药物偶联物，阐明药物体内调控机制。此外，我们还开展了蛋白质与抗体药物等电点、纯度、全序列、二硫键、糖基化、氧化等修饰的质谱分析研究，建立相关质量标准。本年度主要开展了Cdk5和Sds3调控小胶质细胞激活，以及结直肠癌和乳腺癌肿瘤细胞表面蛋白新靶标的大规模筛选研究。

代表论文

Li SP, Li XY, Yang SQ, Pi H, Li ZY, Yao PJ, Zhang Q,Wang QS, Shen PP, Li XZ,Ji JG. (2021) Proteomic landscape of exosomes reveals the functional contributions of cd151 in triple-negative breast cancer.Mol. Cell. Proteomics., 20: 100121.

Liu SJ, Hua Y, Wang JN, Li LY, Yuan JJ, Zhang B, Wang ZY,Ji JG, Kong DC. (2021) RNA polymerase III is required for the repair of DNA double-strand breaks by homologous recombination.Cell, 184: 1314-1329.

Liu Y, Wang L, Xu X, Yuan Y, Zhang B, Li ZY, Xie YC, Yan R, Zheng ZQ,Ji JG, Murray JM, Carr AM, Kong DC. (2021) The intra-S phase checkpoint directly regulates replication elongation to preserve the integrity of stalled replisomes.Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 118: e2019183118.

Xu BY, Zhu L, Wang QS, Zhao YF, Jia M, Shi SF, Lui LJ, Lv JH, Lai WJ,Ji JG, Zhang H. (2021) Mass spectrometry-based screening identifies circulating immunoglobulinA–α1-microglobulin complex as potential biomarker in immunoglobulin A nephropathy.Nephrol. Dial. Transplantat., 36: 782-792.

Bei YC, Cheng N, Chen T, Shu YX, Yang Y, Yang NF, Zhou XY, Liu BR, Wei J, Liu Q, Zheng W, Zhang WL, Su HF, Zhu WG,Ji JG, Shen PP. (2020) CDK5 inhibition abrogates TNBC stem-cell property and enhances Anti-PD-1 therapy.Adv. Sci., 202001417.

Li W, Bai XZ, Li J, Zhao YC, Liu JY, Zhao HY, Liu L, Ding M, Wang QS, Shi FY, Hou M,Ji JG, Gao G, Guo R, Sun YJ, Liu YF, Xu DY. (2019) The nucleoskeleton protein IFFO1 immobilizes broken DNA and suppresses chromosome translocation during tumorigenesis.Nat. Cell Biol., 21: 1273-1285.

Feng G, Yuan Y, Li ZY, Wang L, Zhang B, Luo JC,Ji JG, Kong DC. (2019) Replication fork stalling elicits chromatin compaction for the stability of stalling replication forks.Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.,116: 14563-14572.

Li MZ, Zheng LJ, Shen J, Li XY, Zhang Q, Bai X, Wang QS,Ji JG. (2018)SIRT1 facilitates amyloid beta peptide degradation by upregulating lysosome number in primary astrocytes.Neural Regen Res., 13: 2005-2013.

Xu R, Xu YX, Huo W, Lv ZC, Yuan JS, Ning SK, Wang QS, Hou M, Gao G, Ji JG, Chen JJ,Guo R, Xu DY. (2018) Mitosis-specific MRN complex promotes a mitotic signaling cascade to regulate spindle dynamics and chromosome segregation.Proc Natl Acad Sci U S A.,115: E10079-E10088.

Li MZ, Zhang Q, Shen J et al. (2017) Discovery and identification of serum potential biomarkers for Colorectal Cancer using TMT quantitative proteomics. Int J Cancer Oncol, 4: 1- 7.